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院系:生物信息学

来自维基学院
生物信息学
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Example DNA sequence

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免疫的bioinformatics英语这个词的词根bio,是bi的异体,bi是个希腊词根,在构词中,bi经常通过连接字母-o-与其他词素结合,意思都是life(生命、生物)。单词informatics表示信息学和情报学。

生物信息学(英语:bioinformatics)利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法研究生物学的问题。生物信息学的研究材料和结果就是各种各样的生物学数据,其研究工具是计算机,研究方法包括对生物学数据的搜索(收集和筛选)、处理(编辑、整理、管理和显示)及利用(计算、模拟)。目前主要的研究方向有:序列比对、序列组装、基因识别、基因重组、蛋白质结构预测、基因表达、蛋白质反应的预测,以及建立进化模型。且也是横跨物理、化学、生物和医学的交叉学科。若您对生物信息学有兴趣或有有趣的研究想要分享,欢迎加入维基学院生物信息学的小家庭。

分科规划

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基础课程

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分支学科

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  • 基因组学
  • 转录组学
  • 蛋白质组学
  • 表观遗传学
  • 代谢组学
  • 网络药理学
  • 遗传咨询

课题研究

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数据库与软件

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  • GenePattern:
  • Galaxy

动植物方向

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  • 1.动植物基因组学研究概论
  • 2.动植物基因组denovo组装
  • 3.动植物基因组注释
  • 4.动植物基因组比较基因组和进化分析
  • 5.动植物基因组重测序分析
  • 6.动植物基因组研究技术-RNA水平
  • 7.基于高通量测序技术的动(植)物基因组研究应用
  • 8.动(植)物基因组研究技术-表观遗传学水平

微生物方向

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  • 1.微生物基因组研究
  • 2.环境多样性研究
  • 3.宏基因组分析
  • 4.微生物经典案例分享

癌症方向

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  • 1.肿瘤基因组研究概论
  • 2.肿瘤基因组分析一:体细胞突变的寻找和归类
  • 3.肿瘤基因组分析二:转录组分析
  • 4.肿瘤基因组分析三:甲基化分析
  • 5.肿瘤的单细胞研究

复杂疾病方向

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  • 1.基于二代测序的复杂疾病分析
  • 2.外显子和目标区域测序
  • 3.GWAS基础知识介绍及案例分析
  • 4. de novo mutation的检测与分析

网络药理学

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网络药理学是基于系统生物学的理论,对生物系统的网络分析,选取特定信号节点进行多靶点药物分子设计的新学科。

网络药理学强调对信号通路的多途径调节,提高药物的治疗效果,降低毒副作用,从而提高新药临床试验的成功率,节省药物的研发费用。

药效团模型

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药效团是基于药效特征元素为基础建立的模型。药效特征元素主要分为以下几种,包括:氢键供体、氢键受体、正负电荷中心、芳环中心、疏水基团、亲水基团以及几何构象体积冲撞。

  • 具有相同药理作用的类似物。
  • 化学结构完全不同的分子,但它们以相同的机理与同一受体键合,产生同样的药理作用。

药效团模型靶点预测

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  1. 2d结构(Palmatine chloride)
  2. 3d结构(Palmatine chloride)
  3. 药效团

遗传咨询

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孕前检测

新生儿检测

遗传病检测

贡献者

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