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院系:生物信息學

來自維基學院
生物信息學
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Example DNA sequence

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免疫的bioinformatics英語這個詞的詞根bio,是bi的異體,bi是個希臘詞根,在構詞中,bi經常通過連接字母-o-與其他詞素結合,意思都是life(生命、生物)。單詞informatics表示信息學和情報學。

生物信息學(英語:bioinformatics)利用應用數學、信息學、統計學和計算機科學的方法研究生物學的問題。生物信息學的研究材料和結果就是各種各樣的生物學數據,其研究工具是計算機,研究方法包括對生物學數據的搜索(收集和篩選)、處理(編輯、整理、管理和顯示)及利用(計算、模擬)。目前主要的研究方向有:序列比對、序列組裝、基因識別、基因重組、蛋白質結構預測、基因表達、蛋白質反應的預測,以及建立進化模型。且也是橫跨物理、化學、生物和醫學的交叉學科。若您對生物信息學有興趣或有有趣的研究想要分享,歡迎加入維基學院生物信息學的小家庭。

分科規劃

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基礎課程

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分支學科

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  • 基因組學
  • 轉錄組學
  • 蛋白質組學
  • 表觀遺傳學
  • 代謝組學
  • 網絡藥理學
  • 遺傳諮詢

課題研究

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數據庫與軟件

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  • GenePattern:
  • Galaxy

動植物方向

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  • 1.動植物基因組學研究概論
  • 2.動植物基因組denovo組裝
  • 3.動植物基因組注釋
  • 4.動植物基因組比較基因組和進化分析
  • 5.動植物基因組重測序分析
  • 6.動植物基因組研究技術-RNA水平
  • 7.基於高通量測序技術的動(植)物基因組研究應用
  • 8.動(植)物基因組研究技術-表觀遺傳學水平

微生物方向

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  • 1.微生物基因組研究
  • 2.環境多樣性研究
  • 3.宏基因組分析
  • 4.微生物經典案例分享

癌症方向

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  • 1.腫瘤基因組研究概論
  • 2.腫瘤基因組分析一:體細胞突變的尋找和歸類
  • 3.腫瘤基因組分析二:轉錄組分析
  • 4.腫瘤基因組分析三:甲基化分析
  • 5.腫瘤的單細胞研究

複雜疾病方向

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  • 1.基於二代測序的複雜疾病分析
  • 2.外顯子和目標區域測序
  • 3.GWAS基礎知識介紹及案例分析
  • 4. de novo mutation的檢測與分析

網絡藥理學

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網絡藥理學是基於系統生物學的理論,對生物系統的網絡分析,選取特定信號節點進行多靶點藥物分子設計的新學科。

網絡藥理學強調對信號通路的多途徑調節,提高藥物的治療效果,降低毒副作用,從而提高新藥臨床試驗的成功率,節省藥物的研發費用。

藥效團模型

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藥效團是基於藥效特徵元素為基礎建立的模型。藥效特徵元素主要分為以下幾種,包括:氫鍵供體、氫鍵受體、正負電荷中心、芳環中心、疏水基團、親水基團以及幾何構象體積衝撞。

  • 具有相同藥理作用的類似物。
  • 化學結構完全不同的分子,但它們以相同的機理與同一受體鍵合,產生同樣的藥理作用。

藥效團模型靶點預測

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  1. 2d結構(Palmatine chloride)
  2. 3d結構(Palmatine chloride)
  3. 藥效團

遺傳諮詢

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孕前檢測

新生兒檢測

遺傳病檢測

貢獻者

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