院系:生物信息學

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Example DNA sequence

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免疫的bioinformatics英語這個詞的詞根bio，是bi的異體，bi是個希臘詞根，在構詞中，bi經常通過連接字母-o-與其他詞素結合，意思都是life（生命、生物）。單詞informatics表示信息學和情報學。

生物信息學（英語：bioinformatics）利用應用數學、信息學、統計學和計算機科學的方法研究生物學的問題。生物信息學的研究材料和結果就是各種各樣的生物學數據，其研究工具是計算機，研究方法包括對生物學數據的搜索（收集和篩選）、處理（編輯、整理、管理和顯示）及利用（計算、模擬）。目前主要的研究方向有：序列比對、序列組裝、基因識別、基因重組、蛋白質結構預測、基因表達、蛋白質反應的預測，以及建立進化模型。且也是橫跨物理、化學、生物和醫學的交叉學科。若您對生物信息學有興趣或有有趣的研究想要分享，歡迎加入維基學院生物信息學的小家庭。

分科規劃

基礎課程

• 生物醫學組學背景知識及測序原理
• 生物信息數據格式與數據庫
• 計算機基礎
• 統計學基礎

分支學科

• 基因組學
• 轉錄組學
• 蛋白質組學
• 表觀遺傳學
• 代謝組學
• 網絡藥理學
• 遺傳諮詢

課題研究

數據庫與軟件

• GenePattern：
• Galaxy

動植物方向

• 1.動植物基因組學研究概論
• 2.動植物基因組denovo組裝
• 3.動植物基因組註釋
• 4.動植物基因組比較基因組和進化分析
• 5.動植物基因組重測序分析
• 6.動植物基因組研究技術-RNA水平
• 7.基於高通量測序技術的動（植）物基因組研究應用
• 8.動（植）物基因組研究技術-表觀遺傳學水平

微生物方向

• 1.微生物基因組研究
• 2.環境多樣性研究
• 3.宏基因組分析
• 4.微生物經典案例分享

癌症方向

• 1.腫瘤基因組研究概論
• 2.腫瘤基因組分析一：體細胞突變的尋找和歸類
• 3.腫瘤基因組分析二：轉錄組分析
• 4.腫瘤基因組分析三：甲基化分析
• 5.腫瘤的單細胞研究

複雜疾病方向

• 1.基於二代測序的複雜疾病分析
• 2.外顯子和目標區域測序
• 3.GWAS基礎知識介紹及案例分析
• 4. de novo mutation的檢測與分析

網絡藥理學

網絡藥理學是基於系統生物學的理論，對生物系統的網絡分析，選取特定信號節點進行多靶點藥物分子設計的新學科。

網絡藥理學強調對信號通路的多途徑調節，提高藥物的治療效果，降低毒副作用，從而提高新藥臨床試驗的成功率，節省藥物的研發費用。

藥效團模型

藥效團是基於藥效特徵元素為基礎建立的模型。藥效特徵元素主要分為以下幾種，包括：氫鍵供體、氫鍵受體、正負電荷中心、芳環中心、疏水基團、親水基團以及幾何構象體積衝撞。

• 具有相同藥理作用的類似物。
• 化學結構完全不同的分子，但它們以相同的機理與同一受體鍵合，產生同樣的藥理作用。

藥效團模型靶點預測

1. 2d結構(Palmatine chloride)
2. 3d結構(Palmatine chloride)
3. 藥效團

遺傳諮詢

孕前檢測

新生兒檢測

遺傳病檢測

貢獻者

• 斯陽明（討論） 2020年6月14日 (日) 06:25 (UTC)